Le musée offre les services suivants:

• Visites guidées. en 4 langues (basque, espagnol, anglais et français).
• Expositions. (permanentes, temporaires et itinérantes).
• Activités. autour des thèmes de travail du Musée comme la Culture de la Paix, les Droits Humains et la mémoire historique.
• Département éducatif. pour le travail avec les enfants, les scolaires, les adultes, les familles...
• Boutique. 
• Causeries, cours, conférences. dans centres culturels, établissements scolaires, congrès, etc.
• Vestiaire. 
• Accès pour handicapés.. Le musée dispose d'ascenseur qui facilite l'accès aux personnes présentant un handicap physique.
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• Euskalit (Fondation basque pour l'excelence). 
• Le coin des enfants.