El museo ofrece los siguientes servicios:

• Visitas Guiadas. en 4 idiomas (Euskera, español, inglés y francés).
• Exposiciones. (permanentes, temporales e itinerantes).
• Actividades. en torno a los temas de trabajo del Museo como son la Cultura de Paz, los Derechos Humanos, la historia de la Guerra Civil española y el Bombardeo de Gernika.
• Departamento Educativo. Para el trabajo con niños, escolares, adultos, familias...
• Tienda. 
• Charlas, cursos, conferencias. En centros culturales, centros escolares, congresos etc.
• Guardarropa. 
• Acceso para minusválidos. Mediante su ascensor.
• Carta de servicios. 
• Euskalit (Fundación vasca para la excelencia). 
• Zona infantil.