El logotipo de la Fundación Museo de la Paz de Gernika diseñado en un color verde (Pantone 574 CVC) sobre fondo blanco y con una tipografía en Arial normal y negrita intercalada, muestra un concepto de paz como proceso en un planteamiento físico contemporáneo, siendo a su vez, una imagen que, por su construcción remite a Euskadi y a Gernika , "Ciudad de la Paz".

El cromatismo en verde remite también a la naturaleza, al positivismo y al crecimiento.